Opis techniczny
Zadaniem ECBiG jest prowadzenie badań podstawowych w zakresie bioinformatyki i genomiki, rozwój i wdrażanie nowych oraz już istniejących metod badawczych, praktyczne wykorzystanie uzyskanych wyników w medycynie, biotechnologii i rolnictwie. Dzięki wspólnym staraniom IChB PAN oraz Politechniki Poznańskiej, zgromadzono już dużą część aparatury, niezbędnej do realizacji tych celów. W tabeli wyszczególniono wyłącznie tą aparaturę będącą w posiadaniu IChB PAN, która jest użytkowana w ramach realizowanych wspólnie przez IChB PAN i PP projektów badawczych z zakresu genomiki i bioinformatyki. Wskazano również obecne usytuowanie aparatury w laboratoriach IChB PAN.
Zagospodarowanie przeznaczonych dla ECBiG pomieszczeń w nowym budynku Centrum Wykładowego pozwoli na skupienie rozproszonej w IChB PAN aparatury w 6 nowoczesnych pokojach laboratoryjnych, specjalnie dedykowanych zaawansowanym badaniom genomicznym i proteomicznym. Bezpośrednie sąsiedztwo bioinformatycznej części Centrum zapewni bezpośrednie wsparcie eksperymentalnej części projektów i zdecydowanie przyczyni się do poszerzenia zakresu współpracy biologów i informatyków. ECBiG stanie się tym samym scentralizowanym ośrodkiem, (ang. „core laboratory”) zdolnym zaoferować kompleksowe rozwiązania w dziedzinie genomiki i bioinformatyki i podołać złożonym problemom badawczym.
Do nowych laboratoriów zostanie przeniesiona cała dotychczas zgromadzona specjalistyczna aparatura do produkcji i analiz mikromacierzy oraz zestaw do analiz białkowych. Jednak pozostała aparatura naukowo-badawcza, używana w badaniach genomicznych, jak również elementy wyposażenia laboratoryjnego, są urządzeniami ogólnego zastosowania, współużytkowanymi z członkami różnych pracowni IChB PAN i jako takie nie mogą być przeniesione bez zakłócenia pracy tych pracowni. Stąd też wynika potrzeba uzupełnienia infrastruktury ECBiG o te urządzenia. Ponadto niektóre posiadane urządzenia badawcze, takie jak aparat do ilościowego PCR i system dwukierunkowej elektroforezy białek, już teraz są nadmierne obciążone i powinny być zastąpione nowszymi, wysokoprzerobowymi aparatami, adekwatnymi do skali projektów genomicznych. Zaplanowano również zakup sekwenatora nowej generacji (ang. „next generation sequencing system”), który umożliwi badania strukturalne genomów oraz w znaczący sposób rozszerzy zakres badań transkryptomicznych ECBiG. Urządzenie to umożliwi szybkie (kilkanaście dni!) i dokładne sekwencjonowanie całych genomów i transkryptomów (a w niedalekiej przyszłości praktyczną realizację hasła „sekwencjonowania genomu za 1000 $”, także w ECBiG). Ponadto przewiduje się zakup nowoczesnego spektrometru masowego typu MALDI, sprzężonego z chromatografem, który podniesie czułość i rozdzielczość analiz proteomicznych, a dodatkowo będzie znajdował zastosowanie w obrazowaniu tkanek.
Cała inwestycja jest zaplanowana w ten sposób aby móc bardzo sprawnie przeprowadzać wielopoziomowe badania genomów i uwalnianej z nich informacji. Laboratorium bioinformatyki ma funkcję szczególną. Jest nią integracja wszystkich laboratoriów biologicznych wchodzących w skład ECBiG i analiza pozyskanych danych z tej aparatury.
